我的生物黑科技 第四章 這是硬盤

程翔仔細(xì)盯著屏幕，屏幕上的堿基對(duì)，時(shí)不時(shí)標(biāo)出一段帶問號(hào)的替代符號(hào)，時(shí)不時(shí)又是一段紅色缺失替代符，或疏或密，帶問號(hào)的替代符是遠(yuǎn)在火星掃描時(shí)就已經(jīng)無法確定的堿基對(duì)，而紅色的缺失替代符，則是因?yàn)榛鹦莻鬏敂?shù)據(jù)到地球數(shù)據(jù)發(fā)生了丟失，漫長(zhǎng)的距離，光是信號(hào)抵達(dá)都需要好幾分鐘，要做到傳輸不丟數(shù)據(jù)，代價(jià)太大。

以現(xiàn)在的技術(shù)能力，也沒辦法做到高效的確認(rèn)重發(fā)機(jī)制。有眼前這個(gè)時(shí)間戳表示有信號(hào)沒收到已經(jīng)非常的不錯(cuò)。

“不少錯(cuò)漏啊。”程翔感慨，不過也沒辦法，搞研究就是這樣，哪有那么多理想的條件，“不過，還能有這么多信息，已經(jīng)相當(dāng)?shù)牟诲e(cuò)了。”

“知足吧。”

畢竟，前期最重要的任務(wù)，就是初步確定這個(gè)盒子的價(jià)值，確切的說，是這盒子里基因的價(jià)值。

眼下的工程文件，左側(cè)的活動(dòng)面板上是一個(gè)樹形結(jié)構(gòu)，里面有十個(gè)子節(jié)點(diǎn)，表示著從1到10號(hào)盒子的基因測(cè)序矢量圖文檔，雙擊就可以打開對(duì)應(yīng)的數(shù)據(jù)視圖。這款工程軟件，就是銀河研究所制定的。

有程翔的把關(guān)，一眾專業(yè)生物專業(yè)的專家教授不斷給出意見，這款軟件在使用上自然非常順利可靠。

現(xiàn)在最重要的工作是確定這份基因的研究?jī)r(jià)值，而這種類似解謎般的工作向來都是難度最高的，那種感覺，跟只告訴你前面那座大山里有寶藏，但是不知道埋哪里，要你自己去找一樣。

大海撈針莫過于此。

程翔沒有立刻去查看基因的細(xì)節(jié)，想了想，“被發(fā)現(xiàn)的盒子，在內(nèi)部一共有49個(gè)形狀一致的小盒。”

“這也算是一個(gè)線索，既然如此。”

程翔想起了這款軟件的一個(gè)功能，也是非常方便的功能，就是基因測(cè)序比對(duì)。

和常用的文檔字符串比對(duì)一樣，基因比對(duì)，則是將不同DNA測(cè)序文檔進(jìn)行比對(duì)，比對(duì)的則是堿基對(duì)的排列組合是否一致。不一致的，會(huì)逐個(gè)做下標(biāo)記，比對(duì)完成后，按快捷鍵F3，可以快速依次查看每一個(gè)不同點(diǎn)。

“先比對(duì)下吧。”

“說不定就有了什么發(fā)現(xiàn)。”

探索過程最常見的就是試錯(cuò)，試錯(cuò)，自然也是從成本最低的開始，沒有什么比這個(gè)更簡(jiǎn)單，想到這里，陳翔立刻將使用鼠標(biāo)，選擇全部文檔，右鍵選擇比對(duì)所有。進(jìn)度條頓時(shí)展開，比對(duì)結(jié)果實(shí)時(shí)展示。

一份200MB的DNA圖譜，足夠存儲(chǔ)16億個(gè)堿基對(duì)信息。十份DNA測(cè)序圖譜同時(shí)比對(duì)，這個(gè)運(yùn)算量一般的電腦根本撐不住。不過，得益于軟件需求是一群專業(yè)生物研究工作者提出，所以算法早就考慮到了生物科學(xué)的特殊性。比對(duì)按照增量的方式進(jìn)行，即時(shí)開始，即時(shí)出具實(shí)時(shí)結(jié)果，又可以隨時(shí)終止。

而且，更別提，實(shí)驗(yàn)室大樓內(nèi)部早就配置一部超算，復(fù)雜計(jì)算可以委托超算進(jìn)行處理。以超算每秒10的17次方每秒的運(yùn)算速度，區(qū)區(qū)兩百億數(shù)據(jù)量的比對(duì)工作，根本不值得一提。

進(jìn)度條幾乎是眨眼即過，比對(duì)的結(jié)果應(yīng)聲而出。

程翔緊緊盯住屏幕，屏幕上，一份DNA堿基對(duì)比對(duì)視圖已經(jīng)繪制完成，十份視圖全部重合的部分則打印白色，存在不同則會(huì)黃色標(biāo)注，上去，還能看到各編號(hào)視圖在該位置時(shí)基因的實(shí)際情況。

不過因?yàn)轱@示和內(nèi)存的關(guān)系，顯示器同一時(shí)間只能顯示一個(gè)區(qū)間段的結(jié)果。

這個(gè)區(qū)間分段足足十幾萬個(gè)。

程翔直接翻看旁邊的統(tǒng)計(jì)結(jié)果。

這一看，程翔立刻放下了嘴邊的枸杞茶，神情變得格外凝重。

粗檢驗(yàn)，重合率百分之四十五。

去除丟失片段，重合率百分之六十，

再去掉本身遺失的片段，重合率足足百分之九十九點(diǎn)九九九！

“重合率百分之九十九點(diǎn)九九九！”

程翔深深吸了口氣，拿起旁邊的內(nèi)線電話，就撥通了候志潔的辦公座機(jī)，電話響了兩聲就被接起。

“侯主任，你來一下，我想，我已經(jīng)有了發(fā)現(xiàn)。”

電話那頭的候志潔沒有任何猶豫，她才剛剛把剛才收到的數(shù)據(jù)分發(fā)給各個(gè)小組，其他的都還沒來得及做，程翔這邊就已經(jīng)有了突破，放在其他人身上她會(huì)懷疑對(duì)方的專業(yè)性，但是，放在程翔身上，對(duì)于程翔的快她早就習(xí)慣，二話不說掛斷電話立刻趕了過來。

“程所長(zhǎng)。”候志潔趕到。

“侯主任，你看，統(tǒng)計(jì)結(jié)果！”程翔讓開位置，讓候志潔觀看比對(duì)結(jié)果，候志潔立刻俯身，統(tǒng)計(jì)結(jié)果非常明確。那五個(gè)九的的重合率，分外的顯眼。

“五個(gè)九？如果再排除掉因?yàn)檫h(yuǎn)程傳輸，信號(hào)在中途被擾亂的誤差。”候志潔驚訝，本以為會(huì)非常艱巨的探索性任務(wù)，誰想到這么快就有了實(shí)質(zhì)性的突破。

“沒錯(cuò)，在現(xiàn)在的條件下，可以初步做一個(gè)假設(shè)，那就是，這四十九個(gè)盒子里的DNA序列是完全一致的。”程翔點(diǎn)點(diǎn)頭說道。

“那就是說，這四十九個(gè)盒子的作用，就是一個(gè)備份容錯(cuò)的措施？”候志潔馬上想到了一種可能性。

“應(yīng)該是沒錯(cuò)的。”程翔肯定了候志潔的說法。

“但是，為什么要這么做呢？”候志潔問道，一個(gè)問題得出結(jié)論，總能帶出更多的問題，這是研究的復(fù)雜所在，也是其中的樂趣所在。

“十千克DNA，平攤到四十九個(gè)盒子，以五十進(jìn)行估算的話，每個(gè)盒子的DNA重量為兩百克。這兩百克的基因到底會(huì)是什么？”確定了備份的猜想，縮小了研究的范圍，加快了研究進(jìn)程，但是，對(duì)于價(jià)值的真正評(píng)估，還是要確定基因里面保存的是什么。

“單個(gè)生物體的DNA不可能有那么大，人體單個(gè)細(xì)胞的DNA重量只有3皮克，我現(xiàn)在有個(gè)猜想，這些基因的含義可能并不是某種生物基因，而是利用DNA序列的特性，作為一種存儲(chǔ)介質(zhì)進(jìn)行數(shù)據(jù)保存。”

“以堿基對(duì)序列存儲(chǔ)二進(jìn)制數(shù)據(jù)，生物學(xué)界在實(shí)驗(yàn)室早就獲得了成功。所以，在理論上，這是絕對(duì)可行的。”

“如果真要給一個(gè)猜測(cè)的話，我現(xiàn)在更傾向于這些基因就是生物存儲(chǔ)介質(zhì)。”

“四十九個(gè)盒子，則是存儲(chǔ)陣列。”程翔緩緩說道，“而這個(gè)大盒子的本質(zhì)，就是個(gè)大硬盤！”